与传统作物相比，科学家在转基因作物种植之前所做的安全性评估工作要严格得多，其中就包括环境安全性评估。
通常情况下，科学家对一种转基因作物需要做的环境安全性评价涉及十几项甚至几十项，主要包括四个大的方面：
一是生存竞争能力评价，在自然环境下，与非转基因对照生物相比，评价转基因生物的生存适合度与杂草化风险。
二是基因漂移的环境影响评价，评价转基因生物的外源基因向其他植物、动物和微生物发生转移的可能性及可能造成的生态后果。
三是生物多样性评价，根据转基因生物与外源基因表达蛋白的特异性和作用机理，评价对相关植物、动物、微生物群落结构和多样性的影响，以及转基因植物生态系统中病虫害等有害生物地位演化的风险。
四是靶标害虫抗性风险评价，评价转基因抗性作物可能造成靶标害虫产生抗性的风险。
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