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全球首个!重庆发布血橙高质量基因组

  • 来源:农民日报客户端
  • 编辑:袁雅茹
  • 作者:邓俐
  • 2024-05-28 10:17:00

近日,国际权威学术期刊《Scientific Data》(中文译名《科学数据》)发表重庆市农科院果树所柑橘创新团队(以下简称柑橘创新团队)学术论文《重要甜橙品种——血橙高质量染色体级别基因组》,首次在国际上公开发布血橙高质量基因组。

“基因检测完整性达到98.2%,在基因组研究领域被评价为一组高质量基因组。”论文牵头人、柑橘创新团队首席专家洪林告诉记者。

血橙属于甜橙类品种,酸甜适度、风味浓郁,富含的花青素能为人体带来多种益处,深受消费者青睐。重庆市特色水果产业技术体系创新团队首席专家、市农技站果树科科长孔文斌研究员介绍,国内血橙主要分布在川渝地区,种植总面积超过100万亩,其中重庆有40余万亩,居全市柑橘产业第二,涉及果农10万户左右。

重庆发布全球首个高糖血橙高质量基因组“塔罗科”新系血橙是重庆市血橙的主栽品种。

重庆发布全球首个高糖血橙高质量基因组“塔罗科”新系血橙。

据了解,目前国内种植的血橙多为意大利“塔罗科”血橙变异而来的“塔罗科”新系,这个品种推广已有10余年。为改良品种,近年来,柑橘创新团队一直在潜心开展血橙新品种选育,他们在重庆血橙主产区开展了一轮又一轮“海选”,试图找到优异的育种资源。2019年,他们在育种资源中偶然发现了一株自然变异株,其花青素含量更高,血色更深,糖度也更高。

利用该变异株,柑橘创新团队在江津、开州、万州的试验基地对12亩共500多棵血橙树进行了嫁接,随后逐年记录果实产量、甜度、花青素含量,以及果树的抗病性能等100余项数据。

经过连续4年试验观察,柑橘创新团队发现其性状稳定、特色鲜明,目前正在申请国家新品种权保护和品种登记,暂命名为“内秀”。

重庆发布全球首个高糖血橙高质量基因组“内秀”血橙。

重庆发布全球首个高糖血橙高质量基因组“内秀”血橙血色更深,花青素含量更高。

“它的优异性状十分突出!” 西南大学园艺园林学院曾明教授表示,“经检测,这个由变异株产生的血橙新品系,果实甜度为14.7,花青素含量为每升52.34毫克,都比目前主推品种‘塔罗科’新系要高,产量则与之相当。”

洪林说,新品系血橙的优异性状是由自然变异而来,团队想搞清楚究竟是什么基因在起作用,而国际上尚未有公开发布的高质量血橙基因组,于是柑橘创新团队采用三代基因测序技术,着手“内秀”血橙全基因组测序工作。他介绍,“这次血橙基因测序深度达到65×,共预测到30395个基因。65×的深度可以很好地覆盖基因组的完整信息,这意味着我们检测到的基因完整度、精确度更高。目前完整性达到98.2%,可以说是一组高质量的基因组。”

洪林还表示,对该基因组的深入研究,将不断揭开血橙基因的奥秘,有望挖掘到更多优异的遗传基因,从而培育出更多的优良血橙品种。

作者:农民日报·中国农网记者 邓俐

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